ダイレクト納付とは？フリーランスエンジニアがe-Taxで所得税を口座から納める手順と届出の時期
監修・編集責任者：牛尾 昭昌（株式会社LASSIC 執行役員）
📘 この記事でわかること
- 確定申告の税金は納期限までに自分で納めることと、口座から納める2つの方法の違い
- ダイレクト納付を使うために整えておく3つの準備と、利用届出書の出し方
- 登録完了通知が届くまでの流れと、確定申告の時期より前に届け出る理由
e-Taxで確定申告書を送り終えたあと、税金の納め方を調べていて、ダイレクト納付という方法を知りました。口座から直接納められるなら手間が減ると思いましたが、何を準備すればよいのか、いつまでに届け出ればよいのかが分かりませんでした。ダイレクト納付の利用届出書は、初回だけ出します。
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1. 確定申告の税金は、納期限までに自分で納めます
お知らせは届かないので、自分で動く必要があります
確定申告書を出して納付する税額がある場合は、納期限までに自ら納付する必要があります1。
後日、税務署から納付書や納税通知書等のお知らせが送付されることはありません2。
口座から納める方法には、次の2つがあります。
口座から納める方法は、振替納税とダイレクト納付の2つです
1つ目は振替納税です。事前に届出をした預貯金口座から、国税庁が指定する振替日に自動で口座引落しにより納付する方法です3。令和7年分の確定申告特集では、振替日を申告所得税及び復興特別所得税が令和8年4月23日と案内しています3。
もう1つが、この記事で扱うダイレクト納付です。e-Taxを利用して、事前に届出をした預貯金口座から口座引落しにより納付する方法です4。
2つの方法の引き落とされる日を、表1にまとめます。
| 方法 | 引き落とされる日 |
|---|---|
| 振替納税 | 国税庁が指定する振替日（令和7年分の申告所得税及び復興特別所得税は令和8年4月23日）3 |
| ダイレクト納付 | 即時または指定した期日13 |
この違いを踏まえたうえで、次の節ではダイレクト納付の仕組みをもう少し詳しく見ていきます。
2. ダイレクト納付は、e-Taxから即時または指定した期日に口座から納めます
届出をした口座から、e-Tax経由で引き落とされます
ダイレクト納付（e-Taxによる口座振替）は、e-Taxを利用して、事前に届出をした預貯金口座から口座引落しにより納付する方法です4。
届出をしておけば、e-Taxに登録した口座からの引き落としにより、即時または指定した期日に納付できます13。
通常のダイレクト納付は、納付のたびに指定します
通常のダイレクト納付では、納付の都度、口座からの引き落としを指定する必要があります14。
ダイレクト納付で納める流れを、図1に示します。
出典：国税庁「令和7年分 確定申告特集」、国税庁「ダイレクト分割納付の方法」をもとに作成
この流れを使えるようにするには、事前の準備が要ります。次の節で、その中身を確かめます。
3. 使うための準備は、e-Tax・口座・利用届出書の3つです
e-Taxの利用開始と、対応する口座が要ります
ダイレクト納付を利用するために準備することの1つ目は、e-Taxの利用開始のための手続（利用者識別番号の取得・電子証明書の取得）をしていることです9。
2つ目は、ダイレクト納付のサービスを提供する金融機関に口座を持っていることです10。
3つ目は、利用届出書の提出です
3つ目は、ダイレクト納付の利用届出書を提出していることです11。届出書の出し方と出す時期は、次の節で確かめます。
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4. 利用届出書は初回だけ、オンラインか書面で出します
初回だけの届出で、あとの納付に使えるようになります
ダイレクト納付を利用するには、初回のみ事前に、オンライン（e-Tax）または書面で「ダイレクト納付利用届出書」を提出します5。
オンライン（e-Tax）で提出する場合は、金融機関届出印や電子証明書は要りません6。
使えるようになるまでの期間は、出し方で変わります
届出書を提出してから利用できるようになるまで、書面での提出なら1か月程度かかります。オンラインでの提出の場合は、各金融機関によります8。
出し方ごとの違いを、表2にまとめます。
| 出し方 | 要らないもの・使えるまでの期間 |
|---|---|
| オンライン（e-Tax） | 金融機関届出印や電子証明書は不要6。使えるまでの期間は各金融機関によります8 |
| 書面 | 使えるまで1か月程度8 |
届出書を出したあとの流れは、次の節で確かめます。
5. 登録完了通知が届いてから、改めて納付手続をします
利用届出書を出しただけでは、納付は完了しません
利用届出書を提出しただけでは、納付は完了しません。メッセージボックスに「ダイレクト納付の預貯金口座登録完了通知」が格納されたあとに、改めて納付手続を行います7。
登録完了はメッセージボックスとメールで知らされます
税務署と金融機関の登録手続が完了すると、この通知がメッセージボックスに格納されます。メールアドレスを登録している場合は、メールでも知らされます12。
届出から納付までの流れを、図2に示します。
出典：国税庁「令和7年分 確定申告特集」、国税電子申告・納税システムのよくある質問をもとに作成
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6. 確定申告期間中に届け出ると、その年の納付に間に合わないことがあります
書面での提出は、使えるまでに1か月程度かかります
ダイレクト納付の利用届出書を書面で提出した場合、利用できるようになるまでに1か月程度かかります8。オンライン（e-Tax）で提出したときにかかる期間は、口座を持つ金融機関ごとに異なります8。
そのため、確定申告期間中に利用届出書を出すと、その年の確定申告に基づく納付にダイレクト納付を使えないことがあります8。令和7年分の確定申告期間は、令和8年2月16日から3月16日です8。
間に合わないときも、納期限までに自分で納めます
ダイレクト納付の準備が間に合わなかったときも、確定申告書を提出して納付する税額があるときは、納期限までに自ら納める必要があります1。
届け出る時期と、その年の納付に使えるかどうかを、図3に示します。
出典：国税庁「令和7年分 確定申告特集」をもとに作成
7. 確定申告の前に、3つを確かめます
準備がそろっているかを確かめます
確定申告の前に確かめておきたいことの1つ目は、ダイレクト納付を使うための準備がそろっているかです。e-Taxの利用開始のための手続（利用者識別番号の取得・電子証明書の取得）をしていること9、ダイレクト納付のサービスを提供する金融機関に口座を持っていること10、ダイレクト納付の利用届出書を提出していること11の3つです。
届け出る時期と、通知が届いてからの手続を確かめます
2つ目は、利用届出書を確定申告の時期より前に出したかです。書面での提出は使えるまでに1か月程度かかるため8、確定申告期間に入ってから出すと間に合わないことがあります。
3つ目は、登録完了通知が届いてから、改めて納付手続をするかです。税務署と金融機関の登録手続が完了すると、e-Taxのメッセージボックスに「ダイレクト納付の預貯金口座登録完了通知」が格納されます12。利用届出書を提出しただけでは納付は完了しないため、通知が届いたあとに、改めて納付手続を行います7。確かめる3つを表3に、確かめる順番を図4に示します。
| 確かめること | 内容 |
|---|---|
| 準備 | e-Taxの利用開始、対応する金融機関の口座、利用届出書の提出がそろっているか |
| 時期 | 利用届出書を確定申告の時期より前に出したか |
| 手続 | 登録完了通知が届いてから、改めて納付手続をするか |
図の作成：Remogu編集部。確定申告の前に確かめる観点を整理したもので、統計データではありません
確定申告の税金は、納期限までに自分で納めます1。ダイレクト納付は、届け出た口座から即時または指定した期日に納める方法です13。
ダイレクト納付の利用届出書は、初回だけ出します5。書面なら使えるまで1か月程度かかるので、確定申告の時期より前に出しておきます8。
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出典・参考情報
＊1 国税庁「令和7年分 確定申告特集」キャッシュレス納付（2026年・2026年9月確認）
＊2 国税庁「令和7年分 確定申告特集」キャッシュレス納付（2026年・2026年9月確認）
＊3 国税庁「令和7年分 確定申告特集」キャッシュレス納付 1 振替納税（2026年・2026年9月確認）
＊4 国税庁「令和7年分 確定申告特集」キャッシュレス納付 2 ダイレクト納付（2026年・2026年9月確認）
＊5 国税庁「令和7年分 確定申告特集」キャッシュレス納付 2 ダイレクト納付（2026年・2026年9月確認）
＊6 国税庁「令和7年分 確定申告特集」キャッシュレス納付 2 ダイレクト納付（2026年・2026年9月確認）
＊7 国税庁「令和7年分 確定申告特集」キャッシュレス納付 2 ダイレクト納付（2026年・2026年9月確認）
＊8 国税庁「令和7年分 確定申告特集」キャッシュレス納付 2 ダイレクト納付（2026年・2026年9月確認）
＊9 国税電子申告・納税システム「ダイレクト納付を利用するために準備することはありますか」e-Tax よくある質問（2026年1月5日・2026年9月確認）
＊10 国税電子申告・納税システム「ダイレクト納付を利用するために準備することはありますか」e-Tax よくある質問（2026年1月5日・2026年9月確認）
＊11 国税電子申告・納税システム「ダイレクト納付を利用するために準備することはありますか」e-Tax よくある質問（2026年1月5日・2026年9月確認）
＊12 国税電子申告・納税システム「ダイレクト納付が利用可能となった日は、どのようにして知ることができますか」e-Tax よくある質問（2026年1月5日・2026年9月確認）
＊13 国税庁「ダイレクト分割納付の方法」ダイレクト納付による分割納付とは（2026年4月・2026年9月確認）
＊14 国税庁「ダイレクト分割納付の方法」ダイレクト納付による分割納付とは（2026年4月・2026年9月確認）